কাস্টমস এক্সাইজ ও ভ্যাট কমিশনারেট, রাজশাহী জাতীয় রাজস্ব বোর্ডের অধীন একটি অন্যতম শুল্ক আবগারী ও মূল্য সংযোজন কর কমিশনারেট । ১৯৯১ সনে প্রবর্তিত মূল্য সংযোজন কর ব্যবস্থায় পরোক্ষ করের আওতা সম্প্রসারিত হওয়ায় মাঠ পর্যায়ে রাজস্ব প্রশাসনের গতিশীলতা বৃদ্ধির লক্ষ্যে ২৪ মার্চ ১৯৯৩ সনে কাস্টমস এক্সাইজ ও ভ্যাট কমিশনারেট, রাজশাহী নামে স্বতন্ত্রভাবে কার্যক্রম শুরু হয়।